MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 35165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017622	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587282
2	NC_017622	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	386587282
3	NC_017622	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	386587282
4	NC_017622	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	386587282
5	NC_017622	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587282
6	NC_017622	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587282
7	NC_017622	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386587282
8	NC_017622	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587282
9	NC_017622	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587282
10	NC_017622	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587282
11	NC_017622	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587282
12	NC_017622	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	386587282
13	NC_017622	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386587282
14	NC_017622	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587282
15	NC_017622	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	386587282
16	NC_017622	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587282
17	NC_017622	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587282
18	NC_017622	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587282
19	NC_017622	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	386587282
20	NC_017622	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587282
21	NC_017622	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386587282
22	NC_017622	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386587282
23	NC_017622	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587282
24	NC_017622	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	386587282
25	NC_017622	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	386587282
26	NC_017622	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386587282
27	NC_017622	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386587282
28	NC_017622	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386587282
29	NC_017622	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386587282
30	NC_017622	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587282
31	NC_017622	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	386587282
32	NC_017622	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587283
33	NC_017622	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	386587283
34	NC_017622	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	386587283
35	NC_017622	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587283
36	NC_017622	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587283
37	NC_017622	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386587283
38	NC_017622	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587283
39	NC_017622	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587283
40	NC_017622	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587283
41	NC_017622	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	386587283
42	NC_017622	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587283
43	NC_017622	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587283
44	NC_017622	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587283
45	NC_017622	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587283
46	NC_017622	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386587283
47	NC_017622	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	386587283
48	NC_017622	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587283
49	NC_017622	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587283
50	NC_017622	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587283
51	NC_017622	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587283
52	NC_017622	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386587283
53	NC_017622	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587283
54	NC_017622	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386587283
55	NC_017622	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587283
56	NC_017622	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	386587284
57	NC_017622	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587284
58	NC_017622	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386587284
59	NC_017622	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386587284
60	NC_017622	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	386587284
61	NC_017622	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587284
62	NC_017622	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587284
63	NC_017622	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	386587284
64	NC_017622	AG	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	386587284
65	NC_017622	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	386587284
66	NC_017622	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	386587284
67	NC_017622	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587284
68	NC_017622	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587284
69	NC_017622	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	386587284
70	NC_017622	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587284
71	NC_017622	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386587284
72	NC_017622	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587284
73	NC_017622	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587284
74	NC_017622	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587284
75	NC_017622	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	386587284
76	NC_017622	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386587284
77	NC_017622	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587284
78	NC_017622	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587285
79	NC_017622	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587285
80	NC_017622	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587285
81	NC_017622	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587286
82	NC_017622	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587286
83	NC_017622	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386587286
84	NC_017622	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587286
85	NC_017622	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587286
86	NC_017622	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587286
87	NC_017622	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587286
88	NC_017622	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587287
89	NC_017622	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587287
90	NC_017622	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587287
91	NC_017622	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	386587287
92	NC_017622	AG	3	6	4821	4826	50 %	0 %	50 %	0 %	386587287
93	NC_017622	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587287
94	NC_017622	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	386587287
95	NC_017622	A	6	6	4910	4915	100 %	0 %	0 %	0 %	386587287
96	NC_017622	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587287
97	NC_017622	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587287
98	NC_017622	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	386587287
99	NC_017622	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587287
100	NC_017622	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587287
101	NC_017622	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587287
102	NC_017622	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587287
103	NC_017622	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587287
104	NC_017622	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	386587287
105	NC_017622	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587287
106	NC_017622	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587287
107	NC_017622	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386587287
108	NC_017622	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587287
109	NC_017622	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587287
110	NC_017622	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587287
111	NC_017622	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587287
112	NC_017622	A	6	6	5667	5672	100 %	0 %	0 %	0 %	386587288
113	NC_017622	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	386587288
114	NC_017622	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	386587288
115	NC_017622	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587288
116	NC_017622	A	6	6	5838	5843	100 %	0 %	0 %	0 %	386587288
117	NC_017622	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	386587288
118	NC_017622	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587288
119	NC_017622	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587288
120	NC_017622	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587288
121	NC_017622	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587288
122	NC_017622	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	386587288
123	NC_017622	GAA	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587288
124	NC_017622	GAT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587288
125	NC_017622	ATCA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	386587289
126	NC_017622	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	386587289
127	NC_017622	TTA	3	9	6319	6327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587289
128	NC_017622	ATG	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587289
129	NC_017622	ATT	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587289
130	NC_017622	T	6	6	6478	6483	0 %	100 %	0 %	0 %	386587289
131	NC_017622	GAT	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587289
132	NC_017622	GTTT	2	8	6507	6514	0 %	75 %	25 %	0 %	386587289
133	NC_017622	TCAA	2	8	6534	6541	50 %	25 %	0 %	25 %	386587289
134	NC_017622	A	6	6	6724	6729	100 %	0 %	0 %	0 %	386587289
135	NC_017622	T	6	6	6823	6828	0 %	100 %	0 %	0 %	386587289
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137	NC_017622	TC	3	6	6905	6910	0 %	50 %	0 %	50 %	386587289
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